El Panathinaikos comenzará su andadura con el objetivo de defender su título de la Copa de Grecia contra el Atromitos. Los Verdes fueron sorteados para enfrentarse al equipo del barrio de Peristeri en los octavos de final. El partido de ida se disputará en el campo del Atromitos (del 29 al 31 de octubre de 2024) y el de vuelta en el OAKA (del 3 al 5 de diciembre de 2024). Luego, si los Verdes se clasifican para los cuartos de final, se enfrentarán con el ganador del par Atenas Kallithea – Olympiacos y en semifinales a un equipo entre AEK, Aris, Aegaleo y PAOK.